Bioinformatic tools online - Differential Gene Expression analysis (DESeq2, DESeq, EdgeR)
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Bioinformatic tools online - Differential Gene Expression analysis (DESeq2, DESeq, EdgeR)
In this video, I show you, how you can do a DGE analysis with "Bioinformatic tools online" We start from sorted bam-files coming from a random set of 6 fastq-files and do all post-processing steps until we are ready for the DGE. We look for differences in the results, when using DEseq2, DEseq or EdgeR as DGE-tool. We also test the outcome of ...
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